כפר חנניה העתיקה היא אתר מסוף התקופה הרומית ומן התקופה הביזנטית. באתר 2 בתי כנסת עתיקים, כבשן חרס ששימש לייצור כלי החרס המפורסים של כפר חנניה (כפי שנכתב: כלי שיחין וכלי חנניה אין דרכם להשתבר), מתקנים חקלאיים, אמת מים שנמשכת מהחניון בפרוד, קברי צדיקים ועוד. ממצא מעניין שנמצא וקשור לכפר חנניה העתיקה הוא הכלילה (שנדליר עתיק) שנושא כתובת שמזכירה אץ בית הכנסת העתיק בכפר חנניה. לשון הכתובת הוא זה: זו כלילה תגשאפ קתיפת לאתרה קדישה דכפר חנניה. דכירין לטב, אמן סלה שלום. הכלילה עשויה ברונזה, נמצאה בכפר מכר בסביבות שנת 1,900 ומוצגת כיום במוזיאון המלכותי מארימונט אשר בבלגיה. באתר קיימים שני בתי כנסת. האחד (המוקדם) הוא בית כנסת אשר נחצב בסלע ושוכן במעלה הכפר. השני (המאוחר במקצת) הוא בית הכנסת המפואר אשר שוכן במורדות הכפר. כפי שנזכר קודם האתיר מכיל אמת מים עתיקה אשר הובלה מהחניון שבפרוד והועלתה על הגבעה בעזרת מערכת סכרים מתוחכמת. מומלץ בחום לבקר גם במקטע של אמת המים שנחשף בחניון שבפרוד. האתר נחפר עקב סלילת הכביש מצומת שבע לאזור עמיעד ולא זוהה לפני כן ככפר חנניה. תעשיית הכפר באתר היוותה את מרבית הפרנסה בחציה הראשון של השנה (היא שגשגה עד כדי כך שניתן למצוא חלקי כלים שיוצרו בכפר חנניה בכל הגליל וגם בגולן) ובחציה השני מסקו התושבים זיתים וייצרו שמן זית לפרנסתם. באתר שוכנות גם חורבות כפר אינען הערבי שהתקיים באזור ומבניו נבנו מאבני הכפר הקדום אך הוא ננטש לפני כמה עשרות שנים. מומלץ מאוד לבקר באתר, באתר הקרוב באר שבע הגלילית ובאמת המים העתיקה. הגישה לאתר היא לרוב מן הכביש ליד צומת כפר חנניה (דרך קברי הצדיקים אשר נמצאים על הכביש).מומלץ להיעזר במפה מסקרי צבי אילן אותה ניתן למצוא בספרייה האלקטרונית של רשות העתיקות או להיעזר בנקודות אשר נמצאות בגוגל מאפס.
